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linux 生物信息(Bioinformatics)就像一扇開啟科技發(fā)展之門的鑰匙,在最近數(shù)十年里,快速發(fā)展有了巨大的成果,影響著包括醫(yī)學(xué)、生物、計(jì)算機(jī)科學(xué)等學(xué)科,也更多地影響著我們?nèi)粘5纳?。Linux作為一個(gè)開源、易于安裝和使用的操作系統(tǒng),可以極大的支持我們的生物信息技術(shù)學(xué)習(xí)和應(yīng)用,它具有高性能、功能強(qiáng)大且可靠性高的特點(diǎn),是開發(fā)生物信息領(lǐng)域多種軟件應(yīng)用的理想服務(wù)器環(huán)境。

在Linux上安裝生物信息程序一般有三個(gè)步驟,一是安裝必要的編譯器和必要的系統(tǒng)庫(kù);二是下載源碼并使用相應(yīng)的工具,如make、gcc編譯安裝;三是按照相應(yīng)的參數(shù)設(shè)置環(huán)境變量,使程序能夠在Linux系統(tǒng)中調(diào)用和執(zhí)行。由于Linux操作系統(tǒng)的特性,一般使用命令行的方式完成安裝,這也是使用Linux的一個(gè)要求。
例如,在Linux上編譯一個(gè)Tensorflow程序:
一、安裝必要的軟件包:
sudo apt-get install python-dev python-pip git gcc-4.8 g++-4.8 libcupti-dev
二、下載Tensorflow源程序:
git clone -b r1.10 –depth 1 https://github.com/tensorflow/tensorflow
三、編譯安裝:
cd tensorflow
./configure
make -j
四、設(shè)置環(huán)境變量:
export TENSORFLOW_HOME=tensorflow
通過(guò)以上步驟,就可以在Linux上安裝Tensorflow程序。
Linux可以大大加速生物信息的研究和應(yīng)用過(guò)程,可以完成數(shù)據(jù)采集、預(yù)處理、管理和建模,模型計(jì)算、數(shù)據(jù)可視化等工作,它還可以結(jié)合其他系統(tǒng)來(lái)處理生物信息,為研究和實(shí)踐提供更加強(qiáng)大的功能支持。因此,Linux系統(tǒng)在生物信息學(xué)領(lǐng)域有著重要地位,它是一個(gè)開源、易于獲取和使用,具有高性能和功能強(qiáng)大的選擇,為實(shí)現(xiàn)生物技術(shù)的進(jìn)步和發(fā)展創(chuàng)造了極其重要的基礎(chǔ)。
香港服務(wù)器選創(chuàng)新互聯(lián),2H2G首月10元開通。
創(chuàng)新互聯(lián)(www.cdcxhl.com)互聯(lián)網(wǎng)服務(wù)提供商,擁有超過(guò)10年的服務(wù)器租用、服務(wù)器托管、云服務(wù)器、虛擬主機(jī)、網(wǎng)站系統(tǒng)開發(fā)經(jīng)驗(yàn)。專業(yè)提供云主機(jī)、虛擬主機(jī)、域名注冊(cè)、VPS主機(jī)、云服務(wù)器、香港云服務(wù)器、免備案服務(wù)器等。
網(wǎng)站名稱:探索Linux的生物信息――開啟科技發(fā)展之門(linuxbio)
轉(zhuǎn)載來(lái)于:http://www.5511xx.com/article/djoccdi.html


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