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一塊GPU模擬猴子大腦,普通臺式機變超算,英國大學研究登上Nature子刊

 用計算機模擬動物大腦通常需要一臺強大、昂貴的超級計算機,但最近的一項嘗試表明,安裝了高性能 GPU 的臺式機也能完成這項工作,而且模擬速度比超級計算機還快。

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這項研究來自英國薩塞克斯大學(University of Sussex),研究者利用一臺搭載了 NVIDIA Titan RTX GPU 的臺式 PC 模擬了猴子大腦視覺皮層的一個大型模型。這個模型包含 4.13 × 10^6 個神經(jīng)元和 24.2 × 10^9 個突觸。實驗所用的 GPU 內存是 24GB,價值 2452 英鎊(約合 21780 元)。借助研究者提出的新方法,他們用單個 GPU 進行的模擬比超級計算機速度還快,而且價格要便宜得多。

長期以來,人們一直利用 GPU 來加速 AI 模型的計算,但在一個普通顯卡上運行如此之大的模型還是第一次。

通常來說,這種級別的大腦模擬需要超級計算機來提供強大的內存,但薩塞克斯大學的研究者提出了一種更加高效的技術,可以大幅降低模擬過程中所需存儲的數(shù)據(jù)量。他們的方法被稱為「程序性連接(procedural connectivity)」,相關研究發(fā)表在 Nature 新子刊——《Nature Computational Science》上。這份子刊于 2021 年 1 月啟動,主要發(fā)表與計算技術和數(shù)學模型開發(fā)及使用相關的研究,以及它們在一系列科學學科(包括但不限于生物信息學、化學信息學、地理信息學、計算物理學和宇宙學、材料科學和城市科學)領域的應用。

論文鏈接:https://www.nature.com/articles/s43588-020-00022-7?utm_medium

什么是「程序性連接」?

模擬大腦通常需要一個脈沖神經(jīng)網(wǎng)絡,這是一種特殊的 AI 系統(tǒng),可以模擬大腦的行為,神經(jīng)元通過一系列脈沖信號進行通信。

為了準確地預測脈沖如何影響神經(jīng)元,描述「哪些神經(jīng)元通過突觸連接在一起、如何連接」的信息通常在運行模擬之前生成和存儲。然而,由于神經(jīng)元只是周期性地產(chǎn)生脈沖,將如此大量的數(shù)據(jù)持續(xù)保存在內存中是非常低效的。

為了解決這一問題,研究者提出了「程序性連接」的概念?!赋绦蛐赃B接」可以讓研究者根據(jù)需要實時生成與神經(jīng)元連接相關的數(shù)據(jù),而不是在內存中存儲數(shù)據(jù)并從中檢索信息。這完全消除了在內存中存儲連接數(shù)據(jù)的必要性。

「這些實驗通常需要你提前生成所有連接數(shù)據(jù),并用這些數(shù)據(jù)來填滿內存,而我們的方法就是要避免這一過程?!拐撐淖髡?James Knight 表示。

他還補充說,「使用我們的方法,每次神經(jīng)元發(fā)出脈沖時,連接的細節(jié)就會重新生成?!埂肝覀兝?GPU 的能力,在每次脈沖發(fā)出時重新實時計算連接。」

也就是說,借助 GPU 的強大計算能力,當神經(jīng)元脈沖被激發(fā)時,脈沖神經(jīng)網(wǎng)絡可以「程序性」地生成連接數(shù)據(jù)。

這一方法建立美國學者 Eugene Izhikevich 在 2006 年提出的研究基礎上,但彼時的計算機速度太慢,還不足以讓方法推廣應用。現(xiàn)在,GPU 的算力是 15 年前的 2000 倍,對于「脈沖神經(jīng)網(wǎng)絡」來說,研究時機已經(jīng)成熟。

一臺電腦 + 一塊 GPU,或許就能復現(xiàn)大腦模擬論文

事實上,這項研究的結果不僅能夠與當前最快的超級計算機相媲美,甚至還更快。在靜息態(tài)下,新方法模擬生物體的一秒只需要 8.4 分鐘,比之前的超級計算機模擬節(jié)省了多達 35% 的時間(一個例子就是 2018 年在 IBM Blue Gene/Q 上運行的模擬)。

如同 Knight 介紹的那樣,這是因為 IBM 的設備是由 1000 個連接在一個房間里的計算節(jié)點組成的?!笩o論系統(tǒng)多么復雜,節(jié)點之間仍然存在一些延遲。模型隔得越遠,它就會越慢,而我們的模型速度可以快很多個量級。」

James Knight 和 Thomas Nowotny。

除了提高實驗速度之外,研究者還希望通過這種方法降低此類大型生物模擬研究的硬件門檻。在大腦模擬的研究領域,模型大小很可能以萬億字節(jié)計,但超級計算機只是少數(shù)研究團隊的特權。

還有一點意義是:Knight 及其團隊的研究可以讓神經(jīng)科學和人工智能研究者在他們的本地工作站上模擬大腦回路,同時也可以讓學術界以外的人把他們的游戲本變?yōu)橐慌_可以運行大型神經(jīng)網(wǎng)絡的計算機。

Knight 表示:「 Nature Computational Science 的審稿人在自己的計算機上試驗了這項研究。」因此,如果你有一臺電腦和合適的 GPU,或許也可以查看論文中關于復現(xiàn)的說明部分,并上手一試。

程序性連接非常適合用于大腦模擬實驗的脈沖神經(jīng)網(wǎng)絡,但 Knight 認為,隨著類腦機器學習取得更多進展,更多的人工智能應用也將出現(xiàn)。

研究團隊希望這種辦法能夠助力于科學研究,從而大大降低研究哺乳動物大腦工作方式和研究神經(jīng)系統(tǒng)疾病的成本。大腦模擬也是助力阿爾茨海默氏癥和帕金森氏癥的關鍵工具。

無論是繪制哺乳動物大腦的行為圖,還是開發(fā)更好的語音識別工具,神經(jīng)網(wǎng)絡正在受到學界和業(yè)界更多的關注?,F(xiàn)在,只要有一塊 GPU,誰又能說臥室不可以是夢開始的地方呢?


新聞標題:一塊GPU模擬猴子大腦,普通臺式機變超算,英國大學研究登上Nature子刊
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